2006.12. 本月起執行瑞芳鎮公所委託之『瑞芳鎮鳥類調查』計畫
臺北市建設局召開丹丹-關渡野放評估報告會議
12月
11月
2006.11.25~26. 於關渡自然公園舉辦『濕地多樣性研討會』。
2006.11.11~12. 第八屆台北賞鳥博覽會於關渡自然公園舉辦。
動物園召開丹丹後續處理最後一次專家學者會議，結論由台北市野鳥學會在關渡自然公園野放。
台北市野鳥學會發起野放丹頂鶴（丹丹）小額募款活動
10月
2006.10. 自然叢書系列2 『台灣32種蛙類圖鑑』改版出版。
2006.10. 活動組『冠羽班第15期訓練』課程。
9月
2006.09. 本月起執行水利環境學院委託之『社子島紅樹林疏伐試驗之棲地鳥類調查』計畫·
2006.09.09~28. 新進義工訓練。
8月
2006.08.19~28 協助青輔會辦理『遊學台灣一NPO 青年主題之旅』活動。
2006.08.15 台北國際賞鳥博覽會系列活動展開。
7月
2006.07.04一12. 於新店烏來舉辦四梯次『兒童夏令營』。
2006.07. 本月起執行中華民國野鳥學會委託之『IBA 鳥類調查』計畫。
6月
2006.06. 本月起執行中正紀念公園管理處委託之『中正紀念公園鳥類調查』計畫。
5月
2006.05. 本月起執行水源特定管理局之『水源特定區鳥類調查』計畫。
2006.05.11. 獲得由台達電文教基金會贊助二十一世紀議程協會主辦的『辦公室節能』活動，贊助10 萬元經費，改善鳥會會館照明等節能設施。
4月
2006.04. 本月起執行錫押群境摻化基金會委託之『社子島新舊提防問鳥類調查』計畫。
2006.04.09~30. 於台北縣觀音山舉辦『 觀音觀鷹』活動。
2006.04.01. 首次協助私人企業『華碩』廠慶健行帶入生態導覽活動。
3月
2006.03.21. 野鳥救傷初級班舉辦。
2006.03.19. 第十一屆第二次會員大會召開
2月
2006.02. 自然叢書系列4 『台灣132 種甲蟲圖鑑』出版。
1月
2006.01.23~24. 於台大農場舉辦二梯次『兒童冬令營』。